Medidas individuais de proteção da leptospirose incluem evitar ou reduzir a exposição a águas e solos potencialmente contaminados por leptospiras, assim com evitar o contato com animais potencialmente contaminados. Evidências sugerem que o uso de quimioprofilaxia com doxiciclina antes ou após exposição é capaz de reduzir o risco de doença clínica, mas não impede a ocorrência da infecção como demonstrado pelos testes sorológicos. Medidas de prevenção coletivas, como desratização, são utilizadas com frequência, entretanto, são custosas e precisam ser repetidas rotineiramente para ter benefício.